Reklamací je vyjádřena oprávněná pochybnost o správnosti referenčního údaje. Reklamace na Změnu identifikační parcely a Opravu definičního bodu stavebního objektu se za určitých podmínek zpracovávají automaticky, jiné se neobejdou bez zásahu editora (např. reklamace na doplnění adresy).
Způsob řešení jednotlivých reklamací je popsán v Nápovědě ISÚI. Počty reklamací jsou aktualizovány denně.